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为什么进行蛋白质测序?
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这个问题问的非常有意义.没有学生物的人也知道,基因组测序,为了破译遗传密码.现在密码已破,那进行蛋白质组测序有必要吗?2 K; M. t3 o* u
基因研究贯穿了整个20世纪,100多年里,双螺旋结构的提出,中心法则的发现,直至基因组的重大突破,使基因研究达到了前所未有的深度与广度.
) {# s4 X7 h8 k# M. Y O7 \1 y 然而,基因只是信息的携带者,蛋白质才是执行者.基因组计划有其固有的局限性,基因组测序是否正确,要从其表达的蛋白来验证,否则,只是一堆乱码而已.3.5万左右基因中一半以上是理论推断,需要从蛋白质角度确认.而且,从蛋白质研究的自身发展来看,我们无法逃避蛋白质组表达谱分析,只是时间问题而已.+ O* ~$ p9 A/ w f# ]
以前,对蛋白质的研究是优于基因的,因为PCR,测序自动化使其发展迅猛,这我在明天的生物中提了.80年代末,Hillen Kamp发展的激光解析质谱,Fem J设计的电喷雾质谱可以高效,精确的测量生物大分子的质量,并测定部分序列,进而用于数据库的检索.Mann M等再此基础上通过建立"肽质量指纹图谱与肽序列标签"等技术实现了质谱对蛋白质进行大规模准确快速自动化的测序.
; Z4 c: J- U% ?$ k9 S 蛋白质组(即protenome=protein+genome)是两个词的组合,Wilkins MR于1994年提出.后来就被广泛引用了,此词的准确解释,没有.说法没有统一,带我的老师考过我,她说她博士后进站时老板也考过她.不好答.有兴趣的可以查一下<生物化学>杂志2003年专门有一篇中科院的文章讨论这个问题.' W# `* b- x+ C1 V q
测序的方法,简单的说就是个化学问题.提取蛋白,纯化,跑二维电泳,过质谱.完了.
1 V, L3 N# w9 [8 C7 c. r8 I( w5 O复杂的说,三天三夜也不够.光提取一个细胞器蛋白(如线粒体),你做好了,差不多就nobel了.6 R9 o( _( K- c3 n8 Y3 W
目的： 现实一点,从经济角度简说一下.大家知道蛋白质是致病因子对机体作用的靶分子,是发现药靶的技术平台.而药靶则是制药业的源头.例:20世纪90年代中期有483个药靶,2000种药,80%的是针对这483种药靶.所以,你只有进行测序,从结构推测功能,才能找到更多的新药靶.才能攻克各种不治之症.这里面的商机无限啊!!
2 |; \7 B: Y* B8 O, m; S3 l! W美国立肿瘤研究所出资1000万美圆用于建立蛋白质组数据库. Q# g% T5 h4 o% M. J
欧共体投巨资建立酵母蛋白质组数据库.
& U. x: L% c, Q/ ?, ~9 V; ~英生物技术科研委在全国建立3个研究中心
3 T: l2 v! C9 T( e) j法建立5个区域性遗传基地,1500万美圆.
/ Q5 C# ^! G. j& [; T6 K德700美圆,在东德建立中心.! z; K/ u" P4 s: K4 q7 f2 o
澳1997年计划提出人进行全国动员.% _3 T. T. n3 _! Y) ?/ N0 d6 b
日300万美圆,并提出"生物兴国"计划.+ }- T8 ^3 F) h! J' D ?
无数生物公司加入此次竞争......! `' C; p# s" V
蛋白质组是宏观与微观,动态与静态的桥梁,上承基因组,下启基因制药.前途无可限量.在这个战略上,我国只能从开始不能落后,勇攀前沿,进行蛙跳,才能在接下来竞争更为残酷的制药竞争中不被淘汰.
3 W$ s) S/ e E/ r9 Q6 r. t 人才,是这次大战的争夺制高点.我们这次大潮赶上了,但知识还远远不够.希望大家在制药大潮来临时,长风破浪,直挂云帆
发表于 2007-12-11 15:59:05